可选智能体简介

感谢您阅读到这里!基本的CASSIA工作流程对于大多数情况已经足够。然而,为了处理一些特殊情况,我们现在介绍几个高级智能体。

🤔 不确定性量化智能体(UQ智能体)

大型语言模型可能会犯错;如果我们假设模型每次有80%的机会正确回答,那么通过让模型回答同一个问题五次并采用最频繁的答案,理论上获得正确答案的概率会增加到94.2%!

UQ智能体主要提供这种功能,使CASSIA的答案更加准确和可靠。

🚀 注释增强智能体

该智能体已在之前的工作流程中出现,但您也可以选择将其应用于您选择的簇。注释增强智能体可以阅读CASSIA的注释报告,然后不断生成假设并从簇中检索基因表达信息来验证这些假设,最终优化注释结果。在我们的测试中,这个智能体表现异常出色,是CASSIA的核心创新之一。

⚖️ 细胞类型比较智能体

我们知道基本的CASSIA工作流程输出三种可能的最终注释,按照从最可能到最不可能的顺序排列。有时,我们会遇到模糊的注释。在这种情况下,细胞类型比较智能体可以帮助确定最可能的注释。这个智能体实际上是几个智能体的组合,每个智能体对可能的注释结果进行评分。最终注释是根据这些评分选择的。

🔬 子聚类智能体

单轮聚类通常是不够的。有时,我们对需要提取进行进一步分析的某些簇特别感兴趣。子聚类智能体可以同时比较多个簇,提供更准确和详细的注释。

✨ 注释增强智能体+

该智能体是注释增强智能体的升级版,能够为特定簇执行个性化分析。它仍在不断开发中,请继续关注...

📚 RAG智能体(检索增强生成智能体)

该智能体是CASSIA的核心创新之一。基于用户提供的基本信息,它自动检索标记数据库、细胞本体树,并使用基于PCA的方法对细胞类型生成一系列背景信息,以协助基本的CASSIA工作流程。当需要非常详细或新颖的注释时,该智能体显著提高了CASSIA的性能。由于库依赖关系,RAG智能体目前仅在Python中可用。我们将尽快发布R版本。